Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema3aO08665 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms