Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3239L7N2D9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Gm3239L7N2D9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm3239L7N2D9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3239L7N2D9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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