Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21411J3KMS0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms