Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm21897J3KMP5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms