Protein–RNA interactions for Protein: H3BK29

Vmn2r6, Vomeronasal 2, receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r6H3BK29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn2r6H3BK29 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn2r6H3BK29 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms