Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hmgxb3G3X9M3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms