Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms