Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm42421F6X8D5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm42421F6X8D5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm42421F6X8D5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm42421F6X8D5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm42421F6X8D5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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