Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trip11E9Q512 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trip11E9Q512 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms