Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Phf11cB4XVP9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf11cB4XVP9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms