Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prr29B1ARI9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prr29B1ARI9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms