Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv5A0A0B4J1G9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trbv5A0A0B4J1G9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv5A0A0B4J1G9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv5A0A0B4J1G9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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