Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCDC47Q96A33 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCDC47Q96A33 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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