Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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KNOP1Q1ED39 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KNOP1Q1ED39 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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