Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CCDC142Q17RM4 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC142Q17RM4 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms