Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DUSP6Q16828 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms