Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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HIF1AQ16665 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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HIF1AQ16665 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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HIF1AQ16665 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HIF1AQ16665 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HIF1AQ16665 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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