Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FXNQ16595 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FXNQ16595 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FXNQ16595 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FXNQ16595 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms