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| FXN | Q16595 | AC008962.1-201 | ENST00000605729 | 304 nt | BASIC | 4.16 | □□□□□ -1.74 | | |
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| FXN | Q16595 | DMD-207 | ENST00000378677 | 13932 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | KIF21A-201 | ENST00000361418 | 5044 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AP5M1-201 | ENST00000261558 | 11737 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | PLPPR4-201 | ENST00000370184 | 4505 nt | TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | FAM169A-201 | ENST00000389156 | 5990 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | RNA5SP388-201 | ENST00000362584 | 119 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| FXN | Q16595 | DNAJC8P1-201 | ENST00000554535 | 372 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | HSPE1P7-201 | ENST00000604681 | 321 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ESRRAP2-204 | ENST00000606337 | 280 nt | TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | C7orf77-201 | ENST00000616258 | 548 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AC002076.2-201 | ENST00000617362 | 122 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | MIR6076-201 | ENST00000617521 | 113 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AGTR2-201 | ENST00000371906 | 2882 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ALG14-201 | ENST00000370205 | 9367 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | DDX60L-209 | ENST00000511577 | 6781 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | FAM35DP-201 | ENST00000323387 | 2712 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | ADGRG4-201 | ENST00000370652 | 9820 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | SEMG1-201 | ENST00000372781 | 1662 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | RNU6-336P-201 | ENST00000364891 | 107 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AKAP14-204 | ENST00000371431 | 977 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | Y_RNA.496-201 | ENST00000384444 | 101 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | TRBV24-1-201 | ENST00000390397 | 381 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | SNORD66.1-201 | ENST00000391230 | 76 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | MRPL42P3-201 | ENST00000401492 | 326 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |
| FXN | Q16595 | AL591034.2-201 | ENST00000402839 | 359 nt | BASIC | 4.13 | □□□□□ -1.75 | | |