Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SNAPC1Q16533 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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SNAPC1Q16533 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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SNAPC1Q16533 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNAPC1Q16533 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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