Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCN9AQ15858 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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SCN9AQ15858 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCN9AQ15858 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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