Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms