Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC85BQ15834 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CCDC85BQ15834 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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