Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NPTX1Q15818 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms