Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
HMGN3Q15651 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
HMGN3Q15651 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
HMGN3Q15651 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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