Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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CNN3Q15417 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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