Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
RAB35Q15286 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms