Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPRRQ15256 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPRRQ15256 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPRRQ15256 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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PTPRRQ15256 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRRQ15256 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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