Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms