Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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SHPRHQ149N8 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SHPRHQ149N8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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