Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
ODF1Q14990 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ODF1Q14990 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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