Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A2Q14055 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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