Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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