Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
COL4A6Q14031 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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COL4A6Q14031 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
COL4A6Q14031 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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