Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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ITGA9Q13797 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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ITGA9Q13797 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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ITGA9Q13797 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ITGA9Q13797 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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