Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RUNX3Q13761 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RUNX3Q13761 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms