Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ALCAMQ13740 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ALCAMQ13740 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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