Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HDAC1Q13547 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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