Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TCOF1Q13428 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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TCOF1Q13428 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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