Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
MSLNQ13421 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MSLNQ13421 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
MSLNQ13421 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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