Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
AP3B2Q13367 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
AP3B2Q13367 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms