Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CLN3Q13286 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CLN3Q13286 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CLN3Q13286 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CLN3Q13286 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CLN3Q13286 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.78□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CLN3Q13286 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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