Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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FOXC1Q12948 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXC1Q12948 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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