Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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NFIAQ12857 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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