Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
CHRNEQ04844 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms