Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PTPREP23469 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTPREP23469 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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PTPREP23469 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPREP23469 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPREP23469 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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