Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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COPS7AQ9UBW8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COPS7AQ9UBW8 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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