Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SH3BP4Q9P0V3 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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