Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
GDE1Q9NZC3 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GDE1Q9NZC3 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GDE1Q9NZC3 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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GDE1Q9NZC3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
GDE1Q9NZC3 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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