Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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CTDSP1Q9GZU7 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTDSP1Q9GZU7 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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