Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FAM3DQ96BQ1 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms